Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nemp1Q6ZQE4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms