Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h4Q6ZPZ3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms