Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80Q6ZPV2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ino80Q6ZPV2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ino80Q6ZPV2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms