Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc44a1Q6X893 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc44a1Q6X893 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms