Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms