Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rhox8Q6VSS7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rhox8Q6VSS7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rhox8Q6VSS7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms