Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms