Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc57Q6PHN1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms