Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54bQ6PFE3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad54bQ6PFE3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms