Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtifQ6PEE2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CtifQ6PEE2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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