Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dhx40Q6PE54 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms