Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Taf1cQ6PDZ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms