Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm2lQ6PDS0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms