Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc36Q6PDM4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms