Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms