Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mfsd4aQ6PDC8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mfsd4aQ6PDC8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms