Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RgmaQ6PCX7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms