Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ3

Garem2, GRB2-associated and regulator of MAPK protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem2Q6PAJ3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Garem2Q6PAJ3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem2Q6PAJ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms