Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AtminQ6P9S1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AtminQ6P9S1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms