Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slf2Q6P9P0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms