Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BC061212Q6P8K3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BC061212Q6P8K3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC061212Q6P8K3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC061212Q6P8K3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC061212Q6P8K3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC061212Q6P8K3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BC061212Q6P8K3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms