Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd5Q6P5H6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd5Q6P5H6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms