Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcf1Q6P542 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcf1Q6P542 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf1Q6P542 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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