Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Slx4Q6P1D7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Slx4Q6P1D7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Slx4Q6P1D7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Slx4Q6P1D7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms