Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ptpdc1Q6NZK8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms