Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Asic1Q6NXK8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asic1Q6NXK8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms