Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Colgalt2Q6NVG7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Colgalt2Q6NVG7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms