Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpsf6Q6NVF9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpsf6Q6NVF9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms