Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2surpQ6NV83 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
U2surpQ6NV83 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms