Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SphkapQ6NSW3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SphkapQ6NSW3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SphkapQ6NSW3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms