Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fbxo41Q6NS60 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fbxo41Q6NS60 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fbxo41Q6NS60 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fbxo41Q6NS60 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fbxo41Q6NS60 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fbxo41Q6NS60 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fbxo41Q6NS60 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fbxo41Q6NS60 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fbxo41Q6NS60 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fbxo41Q6NS60 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Fbxo41Q6NS60 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Fbxo41Q6NS60 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fbxo41Q6NS60 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms