Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm4Q6IRU2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms