Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt39Q6IFX4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms