Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc2Q69ZB8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc2Q69ZB8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms