Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms