Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brsk2Q69Z98 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk2Q69Z98 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms