Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna3Q65CL1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms