Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usf2Q64705 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf2Q64705 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms