Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja3Q64448 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja3Q64448 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms