Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ca4Q64444 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ca4Q64444 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ca4Q64444 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms