Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ly6eQ64253 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ly6eQ64253 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms