Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlh2Q64221 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms