Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ccdc18Q640L5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc18Q640L5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ccdc18Q640L5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc18Q640L5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
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