Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga3Q62470 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms