Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vat1Q62465 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms