Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm20865Q62460 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm20865Q62460 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm20865Q62460 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm20865Q62460 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm20865Q62460 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm20865Q62460 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm20865Q62460 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Gm20865Q62460 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm20865Q62460 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm20865Q62460 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm20865Q62460 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm20865Q62460 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20865Q62460 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms