Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp1Q62442 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms