Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa13Q62424 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxa13Q62424 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms