Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha6Q62413 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms