Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff3Q62395 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms